在训练神经网络过程中,需要用到很多工具,其中最重要的三部分是:数据、可视化和GPU加速。本章主要介绍Pytorch在这几方面的工具模块,合理使用这些工具能够极大地提高编码效率。

数据处理

在解决深度学习问题的过程中,往往需要花费大量的精力去处理数据,包括图像、文本、语音或其它二进制数据等。数据的处理对训练神经网络来说十分重要,良好的数据处理不仅会加速模型训练,更会提高模型效果。考虑到这点,PyTorch提供了几个高效便捷的工具,以便使用者进行数据处理或增强等操作,同时可通过并行化加速数据加载。

数据加载

在PyTorch中,数据加载可通过自定义的数据集对象。数据集对象被抽象为Dataset类,实现自定义的数据集需要继承Dataset,并实现两个Python魔法方法:

  • __getitem__:返回一条数据,或一个样本。obj[index]等价于obj.__getitem__(index)
  • __len__:返回样本的数量。len(obj)等价于obj.__len__()

这里我们以Kaggle经典挑战赛"Dogs vs. Cat"的数据为例,来了解如何处理数据。"Dogs vs. Cats"是一个分类问题,判断一张图片是狗还是猫,其所有图片都存放在一个文件夹下,根据文件名的前缀判断是狗还是猫。

import torch as t
from torch.utils import data
import os
from PIL import Image
import numpy as np

class DogCat(data.Dataset):
def __init__(self, root):
imgs = os.listdir(root)
# 所有图片的绝对路径
# 这里不实际加载图片,只是指定路径,当调用__getitem__时才会真正读图片
self.imgs = [os.path.join(root, img) for img in imgs]
def __getitem__(self, index):
img_path = self.imgs[index]
#判断是什么dog->1, cat->0
label = 1 if 'dog' in img_path.split('/')[-1] else 0
#打开图片
pil_img = Image.open(img_path)
#将图片转化成像素矩阵
array = np.asarray(pil_img)
#将矩阵转化成tensor
data = t.from_numpy(array)
return data, label
def __len__(self):
return len(self.imgs)
dataset = DogCat('./data/dogcat/')
img, label = dataset[0] # 相当于调用dataset.__getitem__(0)
for img, label in dataset:
print(img.size(), img.float().mean(), label)

通过上面的代码,我们学习了如何自定义自己的数据集,并可以依次获取。但这里返回的数据不适合实际使用,因其具有如下两方面问题:

  • 返回样本的形状不一,因每张图片的大小不一样,这对于需要取batch训练的神经网络来说很不友好
  • 返回样本的数值较大,未归一化至[-1, 1]

针对上述问题,PyTorch提供了torchvision。它是一个视觉工具包,提供了很多视觉图像处理的工具,其中transforms模块提供了对PIL Image对象和Tensor对象的常用操作。

对PIL Image的操作包括:

  • Scale:调整图片尺寸,长宽比保持不变
  • CenterCropRandomCropRandomSizedCrop: 裁剪图片
  • Pad:填充
  • ToTensor:将PIL Image对象转成Tensor,会自动将[0, 255]归一化至[0, 1]

对Tensor的操作包括:

  • Normalize:标准化,即减均值,除以标准差
  • ToPILImage:将Tensor转为PIL Image对象

如果要对图片进行多个操作,可通过Compose函数将这些操作拼接起来,类似于nn.Sequential。注意,这些操作定义后是以函数的形式存在,真正使用时需调用它的__call__方法,这点类似于nn.Module。例如要将图片调整为224×224224\times 224,首先应构建这个操作trans = Resize((224, 224)),然后调用trans(img)。下面我们就用transforms的这些操作来优化上面实现的dataset。

import os
from PIL import Image
import numpy as np
from torchvision import transforms as T
transform = T.Compose([
T.Resize(224), # 缩放图片(Image),保持长宽比不变,最短边为224像素
T.CenterCrop(224), # 从图片中间切出224*224的图片
T.ToTensor(), # 将图片(Image)转成Tensor,归一化至[0, 1]
T.Normalize(mean=[.5, .5, .5], std=[.5, .5, .5]) # 标准化至[-1, 1],规定均值和标准差
])
class DogCat(data.Dataset):
def __init__(self, root, transforms=None):
imgs = os.listdir(root)
self.imgs = [os.path.join(root, img) for img in imgs]
self.transforms=transforms
def __getitem__(self, index):
img_path = self.imgs[index]
label = 0 if 'dog' in img_path.split('/')[-1] else 1
data = Image.open(img_path)
if self.transforms:
data = self.transforms(data)
return data, label
def __len__(self):
return len(self.imgs)
dataset = DogCat('./data/dogcat/', transforms=transform)
img, label = dataset[0]
for img, label in dataset:
print(img.size(), label)

除了上述操作之外,transforms还可通过Lambda封装自定义的转换策略。例如想对PIL Image进行随机旋转,则可写成这样trans=T.Lambda(lambda img: img.rotate(random()*360))

torchvision已经预先实现了常用的Dataset,包括前面使用过的CIFAR-10,以及ImageNet、COCO、MNIST、LSUN等数据集,可通过诸如torchvision.datasets.CIFAR10来调用,具体使用方法请参看官方文档。在这里介绍一个会经常使用到的Dataset——ImageFolder,它的实现和上述的DogCat很相似。ImageFolder假设所有的文件按文件夹保存,每个文件夹下存储同一个类别的图片,文件夹名为类名,其构造函数如下:

ImageFolder(root, transform=None, target_transform=None, loader=default_loader)

它主要有四个参数:

  • root:在root指定的路径下寻找图片
  • transform:对PIL Image进行的转换操作,transform的输入是使用loader读取图片的返回对象
  • target_transform:对label的转换
  • loader:给定路径后如何读取图片,默认读取为RGB格式的PIL Image对象

label是按照文件夹名顺序排序后存成字典,即{类名:类序号(从0开始)},一般来说最好直接将文件夹命名为从0开始的数字,这样会和ImageFolder实际的label一致,如果不是这种命名规范,建议看看self.class_to_idx属性以了解label和文件夹名的映射关系。

from torchvision.datasets import ImageFolder
dataset = ImageFolder('data/dogcat_2/')
# cat文件夹的图片对应label 0,dog对应1
dataset.class_to_idx
# 所有图片的路径和对应的label
dataset.imgs
# 没有任何的transform,所以返回的还是PIL Image对象
dataset[0][1] # 第一维是第几张图,第二维为1返回label
dataset[0][0] # 为0返回图片数据
# 加上transform
normalize = T.Normalize(mean=[0.4, 0.4, 0.4], std=[0.2, 0.2, 0.2])
transform = T.Compose([
T.RandomResizedCrop(224),
T.RandomHorizontalFlip(),
T.ToTensor(),
normalize,
])
dataset = ImageFolder('data/dogcat_2/', transform=transform)
# 深度学习中图片数据一般保存成CxHxW,即通道数x图片高x图片宽
dataset[0][0].size()

to_img = T.ToPILImage()
# 0.2和0.4是标准差和均值的近似
to_img(dataset[0][0]*0.2+0.4)

Dataset只负责数据的抽象,一次调用__getitem__只返回一个样本。前面提到过,在训练神经网络时,最好是对一个batch的数据进行操作,同时还需要对数据进行shuffle和并行加速等。对此,PyTorch提供了DataLoader帮助我们实现这些功能。

DataLoader的函数定义如下:
DataLoader(dataset, batch_size=1, shuffle=False, sampler=None, num_workers=0, collate_fn=default_collate, pin_memory=False, drop_last=False)

  • dataset:加载的数据集(Dataset对象)
  • batch_size:batch size
  • shuffle::是否将数据打乱
  • sampler: 样本抽样,后续会详细介绍
  • num_workers:使用多进程加载的进程数,0代表不使用多进程
  • collate_fn: 如何将多个样本数据拼接成一个batch,一般使用默认的拼接方式即可
  • pin_memory:是否将数据保存在pin memory区,pin memory中的数据转到GPU会快一些
  • drop_last:dataset中的数据个数可能不是batch_size的整数倍,drop_last为True会将多出来不足一个batch的数据丢弃
from torch.utils.data import DataLoader
dataloader = DataLoader(dataset, batch_size=3, shuffle=True, num_workers=0, drop_last=False)
ataiter = iter(dataloader)
imgs, labels = next(dataiter)
dataiter = iter(dataloader)
imgs, labels = next(dataiter)
imgs.size() # batch_size, channel, height, weight

dataloader是一个可迭代的对象,意味着我们可以像使用迭代器一样使用它,例如:

for batch_datas, batch_labels in dataloader:
train()

dataiter = iter(dataloader)
batch_datas, batch_labesl = next(dataiter)

在数据处理中,有时会出现某个样本无法读取等问题,比如某张图片损坏。这时在__getitem__函数中将出现异常,此时最好的解决方案即是将出错的样本剔除。如果实在是遇到这种情况无法处理,则可以返回None对象,然后在Dataloader中实现自定义的collate_fn,将空对象过滤掉。但要注意,在这种情况下dataloader返回的batch数目会少于batch_size。

class NewDogCat(DogCat): # 继承前面实现的DogCat数据集
def __getitem__(self, index):
try:
# 调用父类的获取函数,即 DogCat.__getitem__(self, index)
return super(NewDogCat,self).__getitem__(index)
except:
return None, None

from torch.utils.data.dataloader import default_collate # 导入默认的拼接方式
def my_collate_fn(batch):
'''
batch中每个元素形如(data, label)
'''
# 过滤为None的数据
batch = list(filter(lambda x:x[0] is not None, batch))
if len(batch) == 0: return t.Tensor()
return default_collate(batch) # 用默认方式拼接过滤后的batch数据
dataset = NewDogCat('data/dogcat_wrong/', transforms=transform)
dataset[5]

dataloader = DataLoader(dataset, 2, collate_fn=my_collate_fn, num_workers=1,shuffle=True)
for batch_datas, batch_labels in dataloader:
print(batch_datas.size(),batch_labels.size())

来看一下上述batch_size的大小。其中第2个的batch_size为1,这是因为有一张图片损坏,导致其无法正常返回。而最后1个的batch_size也为1,这是因为共有9张(包括损坏的文件)图片,无法整除2(batch_size),因此最后一个batch的数据会少于batch_szie,可通过指定drop_last=True来丢弃最后一个不足batch_size的batch。

对于诸如样本损坏或数据集加载异常等情况,还可以通过其它方式解决。例如但凡遇到异常情况,就随机取一张图片代替:

class NewDogCat(DogCat):
def __getitem__(self, index):
try:
return super(NewDogCat, self).__getitem__(index)
except:
new_index = random.randint(0, len(self)-1)
return self[new_index]

相比较丢弃异常图片而言,这种做法会更好一些,因为它能保证每个batch的数目仍是batch_size。但在大多数情况下,最好的方式还是对数据进行彻底清洗。

DataLoader里面并没有太多的魔法方法,它封装了Python的标准库multiprocessing,使其能够实现多进程加速。在此提几点关于Dataset和DataLoader使用方面的建议:

  1. 高负载的操作放在__getitem__中,如加载图片等。
  2. dataset中应尽量只包含只读对象,避免修改任何可变对象,利用多线程进行操作。

第一点是因为多进程会并行的调用__getitem__函数,将负载高的放在__getitem__函数中能够实现并行加速。
第二点是因为dataloader使用多进程加载,如果在Dataset实现中使用了可变对象,可能会有意想不到的冲突。在多线程/多进程中,修改一个可变对象,需要加锁,但是dataloader的设计使得其很难加锁(在实际使用中也应尽量避免锁的存在),因此最好避免在dataset中修改可变对象。例如下面就是一个不好的例子,在多进程处理中self.num可能与预期不符,这种问题不会报错,因此难以发现。如果一定要修改可变对象,建议使用Python标准库Queue中的相关数据结构。

class BadDataset(Dataset):
def __init__(self):
self.datas = range(100)
self.num = 0 # 取数据的次数
def __getitem__(self, index):
self.num += 1
return self.datas[index]

使用Python multiprocessing库的另一个问题是,在使用多进程时,如果主程序异常终止(比如用Ctrl+C强行退出),相应的数据加载进程可能无法正常退出。这时你可能会发现程序已经退出了,但GPU显存和内存依旧被占用着,或通过topps aux依旧能够看到已经退出的程序,这时就需要手动强行杀掉进程。建议使用如下命令:

ps x | grep <cmdline> | awk '{print $1}' | xargs kill
  • ps x:获取当前用户的所有进程
  • grep <cmdline>:找到已经停止的PyTorch程序的进程,例如你是通过python train.py启动的,那你就需要写grep 'python train.py'
  • awk '{print $1}':获取进程的pid
  • xargs kill:杀掉进程,根据需要可能要写成xargs kill -9强制杀掉进程

在执行这句命令之前,建议先打印确认一下是否会误杀其它进程

ps x | grep <cmdline> | ps x

PyTorch中还单独提供了一个sampler模块,用来对数据进行采样。常用的有随机采样器:RandomSampler,当dataloader的shuffle参数为True时,系统会自动调用这个采样器,实现打乱数据。默认的是采用SequentialSampler,它会按顺序一个一个进行采样。这里介绍另外一个很有用的采样方法:
WeightedRandomSampler,它会根据每个样本的权重选取数据,在样本比例不均衡的问题中,可用它来进行重采样。

构建WeightedRandomSampler时需提供两个参数:每个样本的权重weights、共选取的样本总数num_samples,以及一个可选参数replacement。权重越大的样本被选中的概率越大,待选取的样本数目一般小于全部的样本数目。replacement用于指定是否可以重复选取某一个样本,默认为True,即允许在一个epoch中重复采样某一个数据。如果设为False,则当某一类的样本被全部选取完,但其样本数目仍未达到num_samples时,sampler将不会再从该类中选择数据,此时可能导致weights参数失效。下面举例说明。

dataset = DogCat('data/dogcat/', transforms=transform)
# 狗的图片被取出的概率是猫的概率的两倍
# 两类图片被取出的概率与weights的绝对大小无关,只和比值有关
weights = [2 if label == 1 else 1 for data, label in dataset]
weights
from torch.utils.data.sampler import WeightedRandomSampler
sampler = WeightedRandomSampler(weights,\
num_samples=9,\
replacement=True)
dataloader = DataLoader(dataset,
batch_size=3,
sampler=sampler)
for datas, labels in dataloader:
print(labels.tolist())

计算机视觉工具包:torchvision

计算机视觉是深度学习中最重要的一类应用,为了方便研究者使用,PyTorch团队专门开发了一个视觉工具包torchvion,这个包独立于PyTorch,需通过pip instal torchvision安装。在之前的例子中我们已经见识到了它的部分功能,这里再做一个系统性的介绍。torchvision主要包含三部分:

  • models:提供深度学习中各种经典网络的网络结构以及预训练好的模型,包括AlexNet、VGG系列、ResNet系列、Inception系列等。
  • datasets: 提供常用的数据集加载,设计上都是继承torhc.utils.data.Dataset,主要包括MNISTCIFAR10/100ImageNetCOCO等。
  • transforms:提供常用的数据预处理操作,主要包括对Tensor以及PIL Image对象的操作。

from torchvision import models
from torch import nn
# 加载预训练好的模型,如果不存在会进行下载
# 预训练好的模型保存在 ~/.torch/models/下面
resnet34 = models.resnet34(pretrained=True, num_classes=1000)
# 修改最后的全连接层为10分类问题(默认是ImageNet上的1000分类)
resnet34.fc=nn.Linear(512, 10)
from torchvision import datasets
# 指定数据集路径为data,如果数据集不存在则进行下载
# 通过train=False获取测试集
dataset = datasets.MNIST('data/', download=True, train=False, transform=transform)

Transforms中涵盖了大部分对Tensor和PIL Image的常用处理,这些已在上文提到,这里就不再详细介绍。需要注意的是转换分为两步,第一步:构建转换操作,例如transf = transforms.Normalize(mean=x, std=y),第二步:执行转换操作,例如output = transf(input)。另外还可将多个处理操作用Compose拼接起来,形成一个处理转换流程。

from torchvision import transforms 
to_pil = transforms.ToPILImage()
to_pil(t.randn(3, 64, 64))

torchvision还提供了两个常用的函数。一个是make_grid,它能将多张图片拼接成一个网格中;另一个是save_img,它能将Tensor保存成图片。

dataloader = DataLoader(dataset, shuffle=True, batch_size=16)
from torchvision.utils import make_grid, save_image
dataiter = iter(dataloader)
img = make_grid(next(dataiter)[0], 4) # 拼成4*4网格图片,且会转成3通道
to_img(img)
save_image(img, 'a.png')
Image.open('a.png')

持久化

在PyTorch中,以下对象可以持久化到硬盘,并能通过相应的方法加载到内存中:

  • Tensor
  • Variable
  • nn.Module
  • Optimizer

本质上上述这些信息最终都是保存成Tensor。Tensor的保存和加载十分的简单,使用t.save和t.load即可完成相应的功能。在save/load时可指定使用的pickle模块,在load时还可将GPU tensor映射到CPU或其它GPU上。

我们可以通过t.save(obj, file_name)等方法保存任意可序列化的对象,然后通过obj = t.load(file_name)方法加载保存的数据。对于Module和Optimizer对象,这里建议保存对应的state_dict,而不是直接保存整个Module/Optimizer对象。Optimizer对象保存的主要是参数,以及动量信息,通过加载之前的动量信息,能够有效地减少模型震荡,下面举例说明。

a = t.Tensor(3, 4)
if t.cuda.is_available():
a = a.cuda(1) # 把a转为GPU1上的tensor,
t.save(a,'a.pth')

# 加载为b, 存储于GPU1上(因为保存时tensor就在GPU1上)
b = t.load('a.pth')

# 加载为c, 存储于CPU
c = t.load('a.pth', map_location=lambda storage, loc: storage)

# 加载为d, 存储于GPU0上
d = t.load('a.pth', map_location={'cuda:1':'cuda:0'})
t.set_default_tensor_type('torch.FloatTensor')
from torchvision.models import SqueezeNet
model = SqueezeNet()
# module的state_dict是一个字典
model.state_dict().keys()
# Module对象的保存与加载
t.save(model.state_dict(), 'squeezenet.pth')
model.load_state_dict(t.load('squeezenet.pth'))
optimizer = t.optim.Adam(model.parameters(), lr=0.1)
t.save(optimizer.state_dict(), 'optimizer.pth')
optimizer.load_state_dict(t.load('optimizer.pth'))
all_data = dict(
optimizer = optimizer.state_dict(),
model = model.state_dict(),
info = u'模型和优化器的所有参数'
)
t.save(all_data, 'all.pth')
all_data = t.load('all.pth')
all_data.keys()